Deze website maakt gebruik van cookies. We gebruiken cookies om instellingen te onthouden en je bezoek soepeler te laten verlopen. Daarnaast gebruiken we ook cookies voor de verbetering van de website en het verzamelen en analyseren van statistieken. Lees meer over cookies

Philip Lijnzaad

Senior Postdoc
  • Single Cell Genomics
Een snoepwinkel vol data: de vreugde en uitdagingen van single-cell bioinformatica

De data die wordt gegenereerd binnen de single-cell faciliteit is als een ware snoepwinkel voor een bioinformaticus zoals ik: rijk, steeds complexer, omvangrijk en uiteraard van enorme waarde om de processen te begrijpen die verschillende vormen van kinderkanker veroorzaken en in stand houden. Het genereren en verwerken van deze data vereist zorgvuldigheid, aandacht en soms slimme trucjes om het beheersbaar te houden – en dat nog vóór de analyse überhaupt begint! Ik ben betrokken bij al deze ‘dry-lab’ aspecten. Om reproduceerbaar en efficiënt te werken, moeten we zoveel mogelijk automatiseren, wat op zichzelf al een leuke en verrijkende uitdaging is. Onderzoekers vervolgens helpen om deze data te interpreteren is de kers op de taart. Het helpt dat ik al geruime tijd actief ben in dit vakgebied, met kennis die reikt over veel domeinen van de biologie, wiskunde, statistiek, en met flink wat IT-ervaring op zak.

  • Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunotherapy

    • feb. 2024
    • Judith, Wienke, et al
    • Cancer Cell
  • An ERK-dependent molecular switch antagonizes fibrosis and promotes regeneration in spiny mice (Acomys)

    • apr. 2023
    • Antonio, Tomasso, et al
    • Science advances
  • Multi-dimensional profiling of hepatoblastomas and patient-derived tumor organoids uncovers tumor subpopulations with divergent WNT activation profiles and identifies pan-hepatoblastoma drug sensitivities

    • jan. 2023
    • Thomas, Kluiver, et al
    • bioRxiv
  • An engineered tumor organoid model reveals cellular identity and signaling trajectories underlying translocation RCC

    • jan. 2023
    • Maroussia, Ganpat, et al
    • bioRxiv
  • Lysosomal glycogen accumulation in Pompe disease results in disturbed cytoplasmic glycogen metabolism

    • jan. 2022
    • Rodrigo, Canibano-Fraile, et al
    • Journal of Inherited Metabolic Disease
Bekijk alle publicaties