De eerste DNA-monsters zijn geladen in een apparaat dat de volledige code afleest, de NovaSeq 6000 van Illumina. Het DNA is geïsoleerd uit tumorcellen en uit gezonde cellen van patiënten. Zo kunnen de wetenschappers de DNA-codes vergelijken en zien waar ze van elkaar verschillen.
Tumoren verschillen veel per type kanker, maar ook per patiënt. Daardoor kan een behandeling bij de één effectief zijn, terwijl die de ander niet geneest. Het uitpluizen van het DNA kan helpen bij de diagnostiek en het samenstellen van de beste behandeling.
De multidisciplinaire aard van de studie blijkt uit de nauwe samenwerking tussen de genomics-groep, collega Bastiaan Tops van de moleculaire pathologie en de groep van Hans Kristian Ploos van Amstel, hoogleraar Genoomdiagnostiek in het UMC Utrecht. Zo worden alle nodige aspecten samengebracht om de genetische diversiteit van kindertumoren in kaart te brengen.
“Met deze eerste monsters zijn we het pilot-experiment gestart”, zegt Holstege. “Uiteindelijk willen we van elke patiënt die binnenkomt in het Prinses Máxima Centrum het DNA uitpluizen. Allereerst om de juiste diagnose te stellen, en – met toestemming van de ouders en patiënten – willen we het DNA ook gebruiken ter vergroting van onze kennis over de diversiteit van tumoren.”